真宗佛光寺派の本山であるここ佛光寺は、建暦2年親鸞聖人が京都山科に草庵を結んだのがはじまりとされる。もともとは、京都渋谷に寺基があり、当時は「興隆正法寺」の寺号を与えられたが、その後、後醍醐天皇の勅願により「阿弥陀佛光寺」の寺号になった。

現在の地に移築されたのは、天正１４年。豊臣秀吉の懇請により移したという。ご本尊の木造阿弥陀如来立像や聖徳太子立像は重要文化財に指定されている。